Dovrebbe derivare da una forma aferetica del nome Gastone, oppure, più probabilmente, da un soprannome in lingua cimbra originato ad esempio dal vocabolo stoln, "rubare, furto", o anche dal termine stonark, "pietraia", forse ad indicare caratteristiche dell'area dove abitava la famiglia.
Il cognome Stone è molto raro. Stoni è unico.