Potrebbe derivare dal praenomen latino Sextius oppure dal toponimo Sestino (AR) ed indicare il luogo di origine del capostipite.
Il cognome Sestini è specifico dell'area che comprende le province di Firenze, Siena ed Arezzo. Sesta ha un ceppo siciliano ed uno romano. Sestan ha un ceppo in provincia di Trieste. Sestani è quasi unico. Sesti ha un ceppo lombardo, uno toscano ed uno calabrese in provincia di Cosenza. Sestino è quasi unico. Sestu è sardo, del cagliaritano.
Il cognome Sestan è 3556° nella regione Friuli-Venezia Giulia Il cognome Sestan è 647° nella provincia di Trieste Il cognome Sestan è 220° nel comune di PIVERONE (TO)