Potrebbe derivare dal mestiere di fabbricante o venditore di sapone, in alcuni casi potrebbe derivare da toponimi come Saponaro (PZ) o Saponara (ME) ed indicare il luogo di provenienza del capostipite.
Il cognome Saponara dovrebbe avere ceppi nella fascia che congiunge il salernitano al barese attraverso la Basilicata. Saponari ha un ceppo pugliese tra le province di Bari e Taranto. Sapone presenta un ceppo nella provincia di Reggio Calabria. Saponi ha un ceppo in provincia di Rimini. Saponieri è tipico del barese. Saoner è veneto.
Il cognome Saponeri è 20874° nella regione Veneto Il cognome Saponeri è 5527° nella provincia di Padova Il cognome Saponeri è 311° nel comune di CASCINETTE D'IVREA (TO)