Potrebbe derivare da forme apocopaiche del nome medioevale germanico Perlingiero o direttamente dal nome medioevale Perlinus.
Il cognome Perlini ha un ceppo in provincia di Sondrio, uno nel veronese, uno in Romagna, nel pesarese e nell'anconetano ed uno nel romano. Perlino, molto raro, ha un ceppo tra torinese ed astigiano ed uno nel barese. Perli sembrerebbe tipicamente trentino con presenze anche nel vicentino. Perlin, rarissimo, è del veneziano e pordenonese.
Il cognome Perlini è 805° nella regione Marche Il cognome Perlini è 91° nella provincia di Sondrio Il cognome Perlini è 2° nel comune di SENNA COMASCO (CO)