Dovrebbe derivare dal nome Panaìa utilizzato nel catanzarese e originato dal greco Panaghìa, "santissima", ossia la Vergine Maria.
Il cognome Panagia, molto raro, è dell'estrema punta della Calabria. Panagis è quasi unico. Panaia è specifico del catanzarese con un ceppo anche nel crotonese e nel reggino. Panaja, rarissimo, è tipico del reggino.
Il cognome Panaia è 1739° nella regione Calabria Il cognome Panaia è 702° nella provincia di Catanzaro Il cognome Panaia è 10° nel comune di VALLEFIORITA (CZ)