Potrebbe derivare da un soprannome legato al termine letterario palagio, ossia palazzo", usato forse per indicare chi abitava in prossimità di un palazzo, o apparteneva, in qualità di servitù, ad un certo palazzo.
Si ricorda il famoso pittore e architetto bolognese Pelagio Palagi (1775 - 1860).
Il cognome Palagi è toscano, della provincia di Lucca in particolare. Palagini, raro, è presente soprattutto nel pisano.
Il cognome Palagini è 6128° nella regione Toscana Il cognome Palagini è 1276° nella provincia di Pisa Il cognome Palagini è 110° nel comune di SAN MINIATO (PI)