Dovrebbe derivare dal nome Nazareno ("nativo di Nazareth") o dal suo derivato Nazario, molto diffuso nel tardo medioevo, come si evince dal Codice Diplomatico della Lombardia medievale dove all'anno 1093 si legge: "...Tibi Nazario filio quondam Ugonis de civitate Mediolani promitto atque spondeo me ego Iohannes qui vocor portenarius et filius quondam Ambrosii de suprascripta civitate...".
E' anche possibile una derivazione da toponimi come San Nazario (SA) e (VI).
Il cognome Nazario è rarissimo. Nazareni è quasi unico. Nazari è sparso nel nord Italia. Nazarri, molto raro, è specifico del milanese. Nazzario è quasi scomparso e sembrerebbe del sud Italia.
Il cognome Nazzario è 5184° nella regione Molise Il cognome Nazzario è 4051° nella provincia di Lecce Il cognome Nazzario è 69° nel comune di TORO (CB)