Potrebbe derivare dal termine veneto arcaico mazzer, vocabolo con il quale si definiva chi apriva le processioni, dettando appunto il tempo ai partecipanti, incarico probabilmente svolto dal capostipite oppure potrebbe derivare da un soprannome legato ad un mestiere o all'appartenenza ad un corpo militare, ma è anche probabile il collegamento con il nome medioevale germanico Mazzi o Mazzo.
Il cognome Mazzer è specifico del trevisano. Mazer, praticamente unico, è dovuto ad un'errata trascizione del precedente.
Il cognome Mazer è 61474° nella regione Piemonte Il cognome Mazer è 15279° nella provincia di Alessandria Il cognome Mazer è 2008° nel comune di CASALE MONFERRATO (AL)