Dovrebbe derivare dal nome di un artigiano chiamato Jeni (Eugenio) e starebbe ad indicare appunto la famiglia di Mastro Eugenio.
Il cognome Mastrojeni, molto raro, è messinese.
Il cognome Mastrojeni è 11069° nella regione Sicilia Il cognome Mastrojeni è 2802° nella provincia di Messina Il cognome Mastrojeni è 35° nel comune di ANTILLO (ME)