Potrebbe derivare dalla modificazione dialettale del nome latino Magnus (grande) o da germanico Manno (latino Mannus) che significa "uomo".
Il cognome Mannoni sembra avere oltre al ceppo sardo settentrionale anche uno in Liguria e nel Lazio. Mannone ha un ceppo siciliano nel trapanese.
Il cognome Mannoni è 405° nella regione Sardegna Il cognome Mannoni è 147° nella provincia di Sassari Il cognome Mannoni è 2° nel comune di SANTA TERESA GALLURA (SS)