Dovrebbe derivare, direttamente o attraverso una forma ipocoristica, dal vocabolo dialettale magnan che identificava il "calderaio" ossia chi faceva e aggiustava le pentole, oppure dai toponimi come Magnano (BI) e Magnano in Riviera (UD).
Il cognome Magnin è piuttosto raro.
Il cognome Magnin è 992° nella regione Valle d'Aosta Il cognome Magnin è 992° nella provincia di Aosta - Aoste Il cognome Magnin è 57° nel comune di OLLOMONT (AO)