Dovrebbe derivare probabilmente da un soprannome dialettale legato ad un termine riferito ai lavori o a cose che avvengono nel mese di maggio, forse ad indicare nei capostipiti dei braccianti agricoli.
Si hanno tracce di numerose famiglie Magenes già nel Lodigiano all'inizio del 1700.
Il cognome Magenes è circoscritto al milanese. Magenis, decisamente più raro, ha un ceppo nel milanese e presenze anche nel lodigiano e nel pavese.
Il cognome Magenes è 4899° nella regione Lombardia Il cognome Magenes è 1177° nella provincia di Lodi Il cognome Magenes è 23° nel comune di VERNATE (MI)