Potrebbe derivare dal toponimo Longone al Segrino (CO), ma è pure possibile una derivazione da un soprannome legato alle caratteristiche fisiche del capostipite.
Tracce di Longoni si trovano a Seregno (MI) fin dal 1400.
Il cognome Longoni è tipico del nordmilanese, varesotto e comasco.
Il cognome Longone è 5108° nella regione Puglia Il cognome Longone è 1368° nella provincia di Taranto Il cognome Longone è 20° nel comune di LONGONE SABINO (RI)