Dovrebbe deriva dal nome medioevale di origine gotica Guarnerius di cui si ha un esempio nel Codice Diplomatico della Lombardia medievale all'anno 1155 in Vimercate dove in un atto si legge: "Anno ab incarnatione domini nostri Iesu Christi milleximo centeximo quinquageximo sesto, mense decembris, inditione quarta.... ...Ego Andreas presbiter ac prepositus subscripsi. Ego Ambrosius de Belusco subscripsi. Ego Guarnerius clericus subscripsi. ...".
Tracce di questa cognomizzazione si trovano in un atto del 1399 redatto dal notaio Guarnerio in Busto Arsizio (VA).
Il cognome Guarnerio è tipico lombardo tra milanese e bergamasco, probabilmente di Pontirolo Nuovo (BG).
Il cognome Guarnerio è 4162° nella regione Lombardia Il cognome Guarnerio è 1029° nella provincia di Como Il cognome Guarnerio è 10° nel comune di PONTIROLO NUOVO (BG)