Dovrebbe derivare dal nome medioevale Giglio oppure da uno dei vari toponimi contenenti il termine giglio.
Il cognome Gigli è specifico del centro Italia, delle Marche e in particolare della Toscana.
Il cognome Gigliano è 5152° nella regione Campania Il cognome Gigliano è 2235° nella provincia di Matera Il cognome Gigliano è 135° nel comune di ASCEA (SA)