Dovrebbe derivare dal nome medioevale Ghisellus, di cui si ha traccia ad esempio in uno scritto romano del 1318: "...vexillifer iustitie de Porta Domus Ghisellus...". Tracce di questa cognomizzazioni si hanno ad esempio a Barletta (BA) con l'abate Paulus Ghiselli nel 1500.
Il cognome Ghiselli ha un ceppo tra ravennate e pesarese ed uno nel lucchese. Ghisellini, abbastanza raro, è tipico del ferrarese e rodigino.
Il cognome Ghisellini è 2707° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Ghisellini è 216° nella provincia di Rovigo Il cognome Ghisellini è 18° nel comune di FIESSO UMBERTIANO (RO)