Potrebbe derivare da un soprannome originato dal termine italiano gerla, a sua volta derivato dal vocabolo tardo latino gerula (cesta conica con due cinghie in cui si infilano le braccia per sostenerla dietro le spalle), caratteristica dei paesi d'alta montagna e dell'Italia settentrionale.
Secondo un'altra ipotesi dovrebbe invece essere legato al cognome tedesco Gerling (composto dal termine alto-tedesco ger/gar, "lancia/giavellotto", e -ling, suffisso che indica possesso, discendenza. Gerling significa dunque "discendente della lancia o del lanciere").
Il cognome Gerlini ha un piccolo ceppo toscano ed uno romano.
Il cognome Gerlini è 8144° nella regione Toscana Il cognome Gerlini è 2059° nella provincia di Siena Il cognome Gerlini è 41° nel comune di RADICOFANI (SI)