Potrebbe avere un'origine normanna e derivare da un'italianizzazione del nome Flahauw (alterazione del nome medioevale germanico Fladwulf, a sua volta composto dai termini flat, "purezza", e wulf, "lupo", con il significato di "lupo di razza pura").
Potrebbe trattarsi anche di un cognome di fantasia attribuito ad un trovatello.
Il cognome Flaccovio, molto raro, sembrerebbe specifico di Palermo.
Il cognome Flaccovio è 8473° nella regione Sicilia Il cognome Flaccovio è 3112° nella provincia di Palermo Il cognome Flaccovio è 400° nel comune di FAVIGNANA (TP)