Dovrebbe derivare da modificazioni dialettali dell'aferesi di un diminutivo del nome Stefano.
Il cognome Fanin ha un ceppo nel vicentino ed uno nel basso udinese e goriziano. Fanini ha un nucleo veronese ed un ceppo nel perugino.
Il cognome Fanini è 1005° nella regione Umbria Il cognome Fanini è 297° nella provincia di Ascoli Piceno Il cognome Fanini è 1° nel comune di MALTIGNANO (AP)