Potrebbe avere un'origine germanica e derivare da un soprannome originato dal vocabolo ecklin, il diminutivo del termine cimbro eicke, "dosso, piccolo monte", forse ad identificare le caratteristiche della località di provenienza del capostipite.
Il cognome Eccli è tipico delle province di Trento e Bolzano.
Il cognome Eccli è 722° nella regione Trentino-Alto Adige Il cognome Eccli è 481° nella provincia di Bolzano - Bozen Il cognome Eccli è 2° nel comune di SALORNO SULLA STRADA DEL VINO (BZ)