Dovrebbe derivare dal nome greco Cilla.
Tracce di questa cognomizzazione si trovano nel pescarese fin dal 1700.
Il cognome Cilli sembra avere un nucleo in Abruzzo ed un ceppo nel barese. Cilla ha un ceppo in provincia di Potenza.
Il patronimicoDi Cillo ha presenze in Molise ed in Puglia.