Dovrebbe derivare da un soprannome basato sul termine sardo logudorese cuscusa o cuscuso, una specie di minestra a base di semolino, oppure da cuscusòni che indica quella parte delle spighe dei cereali che rimangono attaccati ai vestiti, forse usato per descrivere una persona fastidiosa e insistente.
Il cognome Cuscusa, decisamente sardo, ha un ceppo nell'oristanese e nel nuorese.
Il cognome Cuscusa è 1315° nella regione Sardegna Il cognome Cuscusa è 336° nella provincia di Oristano Il cognome Cuscusa è 2° nel comune di SODDÌ (OR)