Potrebbe derivare da un soprannome legato al toponimo Crotta d'Adda (CR) o al termine latino crypta, crupta, "grotta".
Il cognome Crotti è lombardo emiliano, con grossa concentrazione nell'area compresa tra le province di Brescia, Bergamo e Cremona. Crotta è lombardo piemontese così come il più raro Crotto. Crottini, molto raro, è lombardo.
Il cognome Crotta è 1886° nella regione Valle d'Aosta Il cognome Crotta è 178° nella provincia di Lecco Il cognome Crotta è 4° nel comune di ROMAGNESE (PV)