Dovrebbe derivare da un soprannome originato dal vocabolo cóngiu che è il termine della lingua sarda per definire un certo tipo di boccale di terra cotta, quindi starebbe ad indicare il mestiere di vasaio o farebbe riferimento ad aneddoti richiamati alla memoria da quel termine.
Il cognome Congiu è tipico della Sardegna. Congera, molto raro, è specifico del cagliaritano.
Il cognome Congera è 1132° nella regione Sardegna Il cognome Congera è 565° nella provincia di Cagliari Il cognome Congera è 15° nel comune di SIURGUS DONIGALA (SU)