Potrebbe derivare dal nome personale latino Caecilius, il nome gentilizio della gens Caecilia, una delle più importanti e ricche famiglie dell'antica Roma, il cui nome dovrebbe derivare dal termine latino coeculus, "quasi cieco, che vede a fatica".
Il cognome Cecilia è tipicamente laziale, di Roma, del frusinate, di Rieti e di Latina. Cecili ha un piccolo ceppo perugino ed uno nel romano e nel frusinate. Cecilio, quasi unico, è del centro Italia.