Dovrebbe derivare dal nome medioevale Buonus originato a sua volta dal nomen latino Bonus.
Si trova un esempio in una lettera al podestà di Pistoia del 1432, dove si legge: "...Doni et Buonus Niccolai Buoni de Businis ...".
Il cognome Buoni, molto raro, è tipico toscano.
Il cognome Buoni è 3923° nella regione Toscana Il cognome Buoni è 619° nella provincia di Siena Il cognome Buoni è 57° nel comune di PIANCASTAGNAIO (SI)