Potrebbe derivare da soprannomi originati da una forma ipocoristica di appartenenza dell'aferesi del termine dialettale veneto imbonio, zona ripianata, interrata, recuperata dai fiumi, probabilmente ad indicare che i capostipiti provenissero da aree bonificate.
In alcuni casi potrebbe derivare da una modificazione del nome Bono.
Il cognome Boniolo è tipico di Rovigo, di Padova e del padovano. Bonioli parrebbe del veronese, di Verona in particolare.
Il cognome Bonioli è 7219° nella regione Valle d'Aosta Il cognome Bonioli è 2216° nella provincia di Cremona Il cognome Bonioli è 36° nel comune di CAZZANO DI TRAMIGNA (VR)