Dovrebbe derivare dal nome Bonavera (letteralmente "veramente buona").
Il cognome Bonavera è sparso in tutta la penisola con massima concentrazione in Liguria. Bonaveri ha un ceppo piemontese nel torinese, ed uno emiliano nel bolognese.
Il cognome Bonavera è 1701° nella regione Liguria Il cognome Bonavera è 333° nella provincia di Imperia Il cognome Bonavera è 12° nel comune di DIANO SAN PIETRO (IM)