Dovrebbe derivare dal nome Bonavera (letteralmente "veramente buona").
Il cognome Bonavera è sparso in tutta la penisola con massima concentrazione in Liguria. Bonaveri ha un ceppo piemontese nel torinese, ed uno emiliano nel bolognese.
Il cognome Bonavera è 1715° nella regione Liguria Il cognome Bonavera è 326° nella provincia di Imperia Il cognome Bonavera è 8° nel comune di DIANO SAN PIETRO (IM)