Potrebbe derivare dal nome bonarda che indica un particolare vitigno o dal nome longobardo Bono con l'aggiunta di un hard, "duro, coraggioso".
Il cognome Bonardi è tipico della parte nord occidentale dell'Italia con maggiore concentrazione nella provincia di Brescia. Bonara è lombardo e modenese. Bonardelli, molto raro, ha un ceppo nel bresciano ed uno nel messinese. Bonardello, altrettanto raro, è specifico del cuneese. Bonardini, quasi unico, sembrerebbe dell'Italia settentrionale. Bonardo è decisamente piemontese, di Torino e del cuneese. Boniardi, molto raro, è specifico del milanese e basso varesotto.
Il cognome Bonara è 8030° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Bonara è 1671° nella provincia di Modena Il cognome Bonara è 25° nel comune di FOSSA (AQ)