Potrebbe derivare da un soprannome legato alle caratteristiche comportamentali (simili agli uccelli rapaci, le aquile) o anche dal toponimo L'Aquila, capoluogo dell'Abruzzo.
Tracce di questo cognome si trovano nel 1300 con il Signore di Anagni Giacomo Caetani (o Gaetani) dell’Aquila (1338 ca.- 1423).
Il cognome Aquila è sparso un po' in tutto il sud. Aquilina è siciliano, dell'agrigentino. D'Aquila è siciliano, con un ceppo anche molisano. Dell'Aquila è pugliese e campano, con un possibile ceppo romano. Aquilone è del sud Italia. Aquiloni potrebbe essere toscano.
Il cognome Aquilina è 3580° nella regione Sicilia Il cognome Aquilina è 650° nella provincia di Agrigento Il cognome Aquilina è 14° nel comune di CALTABELLOTTA (AG)