Dovrebbe derivare da una modificazione del nome Agata, mutatosi prima in Aghjta e quindi in Ajta e Aita.
Secondo un'ulteriore ipotesi si tratta di una variante tipicamente toscana dal ceppoAiuti, che proviene dal sostantivo aiuto (e dal più antico aita). Il cognome si è formato molto probabilmente da un soprannome dato a persone particolarmente generose.
Il cognome Aita sembrerebbe avere tre ceppi: nell'udinese, nel napoletano e nel cosentino. Aito, più raro, potrebbe essere del salernitano.