Dovrebbe derivare dal termine acqua riferito a mestieri antichi e medioevali legati al commercio dell'acqua o a toponimi che hanno legami con luoghi acquosi. Secondo un'altra teoria potrebbe derivare, direttamente o attraverso una forma aferetica, dal nome medioevale germanico Achari, a sua volta derivato dai termini ac, "filo/lama della spada" ed hari, "esercito" oppure dal nome ebraico Acharon con il significato di "ultimo".
Il cognome Acquaroni, molto raro, sembrerebbe del mantovano.
Il cognome Acquaroni è 14291° nella regione Sardegna Il cognome Acquaroni è 2871° nella provincia di Mantova Il cognome Acquaroni è 149° nel comune di CASALMAGGIORE (CR)