Potrebbe avere un'origine veneta e derivare da un soprannome basato sul termine dialettale veneziano arcaico zonzin, "giuntino, piccola aggiunta", oppure da una forma ipocoristicaaferetica dialettale veneta del nome medioevale Bonaggiunta (prima diventerebbe per aferesi Giunta, poi si avrebbe l'ipocoristico Giuntino che alterato dialettalmente sarebbe poi diventato Giontin è quindi Zonzin).
Il cognome Zonzini è tipico del veronese, con qualche presenza anche nell'area riminese. Zonzin è tipicamente veneto, del veronese e del padovano.