Potrebbe derivare da un soprannome dialettale originato dal fatto che il capostipite fosse nato in gennaio o arrivato in zona comunque in gennaio.
E' anche possibile una derivazione dal nome Gennaro attraverso la sua forma veneta Zenèr.
Il cognome Zener, rarissimo, è tipico veneziano. Zeneri è estremamente raro, sembrerebbe dell'area lodigiano milanese. Zenerin è quasi unico.