Potrebbe trattarsi di una forma aferetica di ipocoristici del nome Giovanni, che prima diventa Giovannotto e poi Vanotto, Vanotti, Vanotta.
Il cognome Vanotti è tipicamente lombardo, della Valtellina in particolare, del sondriese e del bergamasco. Vanotto, rarissimo, è del torinese. Vanotta, praticamente unico, è dell'alessandrino.