Potrebbe derivare dalla Gens Sidonia, o anche dal cognomen latino Sidonius, di cui si ha un esempio con il Patrizio Romano e scrittore gallo latino del V secolo Caius Sollius Apollinaris Modestus Sidonius, anche se non si può escludere che in qualche caso indichino un'origine dalla città di Sidone nell'attuale Libano.
Il cognome Sidonia, praticamente unico, è abruzzese. Sidone è quasi unico. Sidoni ha un ceppo nel bergamasco, uno nell'aquilano ed uno a Roma. Sidonio, molto raro, ha un piccolo ceppo nel pavese, uno nel pescarese ed uno nel frusinate.
Il cognome Sidonia è 23614° nella regione Trentino-Alto Adige Il cognome Sidonia è 10072° nella provincia di Vicenza Il cognome Sidonia è 175° nel comune di CORVARA IN BADIA (BZ)