Potrebbe derivare da soprannomi legati al capostipite che abitava in prossimità di una chiesa dedicata a Sant'Agostino.
Il cognome Santagostino è tipico del milanese e del pavese.
Il cognome Santagostino è 1168° nella regione Lombardia Il cognome Santagostino è 193° nella provincia di Pavia Il cognome Santagostino è 1° nel comune di BESATE (MI)