Potrebbe derivare dal nome rinascimentale Puttino con il significato di "angioletto", oppure trattarsi di un cognome attribuito a dei fanciulli abbandonati, questo tipo di usanza era spesso motivata dal fatto che l'insegna di molti istituti Degli Innocenti (orfanotrofi) contenesse dei putti sorridenti.
Il cognome Puttini sembrerebbe avere un ceppo veneto nel veronese, uno piccolo nel comasco e nel mantovano, uno nel bolognese e nel reggiano, ed uno in Toscana nel senese. Puttin è tipicamente veneto, con un ceppo nel trevisano ed uno nel padovano.
Il cognome Puttini è 5562° nella regione Veneto Il cognome Puttini è 1123° nella provincia di Mantova Il cognome Puttini è 9° nel comune di VALSOLDA (CO)