Dovrebbe derivare dal termine medioevale prestre collegato all'aferesi del diminutivo del nome Giuseppe starebbe ad indicare la famiglia di un Prete Giuseppe.
Il cognome Prestapino, quasi unico, è del catanese ed è probabilmente dovuto ad un errore di trascrizione di Prestipino che è specifico del messinese ed alto catanese.
Il cognome Prestipino è 1266° nella regione Sicilia Il cognome Prestipino è 303° nella provincia di Messina Il cognome Prestipino è 9° nel comune di PAGLIARA (ME)