Potrebbe derivare dal vocabolo sardo legato al tardo latino pullionis che significa "uccello, pulcino" oppure al termine Su pilloni che significa "germoglio di un albero".
Si ha traccia del cognome tra i firmatari della Pace di Eleonora, LPDE del 1388, figura: Pilloni (de) Joanne - de Castri Januensis (Castelsardo).
Il cognome Pilloni è tipico del sud e del sud-ovest della Sardegna ed è diffuso nel cagliaritano, nel Campidano, nell'iglesiente e nell'oristanese. Pillone, rarissimo, è probabilmente dovuto ad errori di trascrizione.
Il cognome Pillone è 12056° nella regione Valle d'Aosta Il cognome Pillone è 2357° nella provincia di Asti Il cognome Pillone è 37° nel comune di CARTOSIO (AL)