Potrebbe derivare da un soprannome originato dal mestiere di fabbricante di pentole oppure da alcuni toponimi come ad esempio Pignataro Maggiore (CE) o Pignataro Interamna (FR).
Tracce di questa cognomizzazione si trovano a Napoli nella seconda metà del 1700 con Carlo Pignataro Delegato Protettore e Governatore del sacro Monte e Banco de Poveri.
Il cognome Pignatari è rarissimo e sparso a macchia di leopardo sulla penisola.
Il cognome Pignatari è 5080° nella regione Basilicata Il cognome Pignatari è 2026° nella provincia di Crotone Il cognome Pignatari è 60° nel comune di POLLICA (SA)