Potrebbe derivare dal fatto che i capostipiti appartenessero al corpo militare dello stato Pontificio o che fossero dei sostenitori del Papa.
Il cognome Papalini è presente in Toscana, soprattutto nel grossetano, nel perugino, nell'anconetano, nel viterbese e nel romano. Papalino, molto più raro, ha un piccolo ceppo nel salernitano ed uno nel barese.
Il cognome Papalino è 6872° nella regione Calabria Il cognome Papalino è 2522° nella provincia di Ascoli Piceno Il cognome Papalino è 64° nel comune di BARCIS (PN)