Dovrebbe derivare dal nome Panaìa utilizzato nel catanzarese e originato dal greco Panaghìa, "santissima", ossia la Vergine Maria.
Il cognome Panagia, molto raro, è dell'estrema punta della Calabria. Panagis è quasi unico. Panaia è specifico del catanzarese con un ceppo anche nel crotonese e nel reggino. Panaja, rarissimo, è tipico del reggino.
Il cognome Panaja è 6375° nella regione Calabria Il cognome Panaja è 2402° nella provincia di Reggio Di Calabria Il cognome Panaja è 40° nel comune di STIGNANO (RC)