Potrebbe derivare da un soprannome dialettale basato sul termine siciliano pajno, "persona vacua e frivola", oppure da una contrazione del nome Paglino, un ipocoristico di Paglia.
I Paino godettero del titolo di barone di Luccoveni e di Duca di Verdura.
Il cognome Paino ha un ceppo napoletano ed ha alcuni ceppi in Sicilia, in particolare sull'isola di Lipari, ad Agrigento, Messina, Catania e Palermo. Pajno ha un ceppo a Lipari.