Potrebbe derivare, direttamente o tramite ipocoristici, da soprannomi originati dal termine dialettale paccagna, "colpo, botta", ma anche "nespola".
Il cognome Paccagnini ha un ceppo nel milanese, uno nel pistoiese e nel senese, un piccolo ceppo è presente anche ad Alghero nel sassarese.
Paccagna, molto raro, ha un ceppo nel sudmilanese e lodigiano.
Paccagni, quasi unico, parrebbe del varesotto.
Paccagnino, praticamente unico, parrebbe del novarese.