Dovrebbe derivare da un soprannome originato dal termine ninin, "piccino", o anche da una forma ipocoristicaaferetica del nome Antonio.
Il cognome Ninin è friulano, tipico di Gorizia.
Il cognome Ninin è 9210° nella regione Friuli-Venezia Giulia Il cognome Ninin è 2385° nella provincia di Gorizia Il cognome Ninin è 198° nel comune di CAPRIVA DEL FRIULI (GO)