Dovrebbe derivare dal cognomen latino Mutinus.
Si ricorda Mutinus Tutunus il dio latino dei pastori protettore della fertilità femminile.
Tracce di queste cognomizzazioni si trovano nella seconda metà del 1400 con Stefano Mutini, ammiraglio della flotta della repubblica di Genova e prefetto marittimo sotto papa Alessandro VI.
Il cognome Mutinelli ha un ceppo trentino ed uno nel veronese. Mutini, probabilmente ligure, e Mutino sono molto rari.
Il cognome Mutinelli è 1161° nella regione Trentino-Alto Adige Il cognome Mutinelli è 735° nella provincia di Trento Il cognome Mutinelli è 20° nel comune di ALA (TN)