D'origine arbëreshë, nasce da diverse italianizzazioni del cognome albanese Muzaka (con una variante in Muzhaka) che deriverebbe da Molassaqje, termine che, in albanese, indica il popolo dei Molossi (un'antica tribù greca, stanziata nel nord dell'Epiro) oppure dal territorio albanese conosciuto come piana di Myzeqe o Myzeqeja.
Il cognome Musacchio ha un ceppo nel campobassese ed un ceppo nell'area che comprende la Basilicata, il cosentino ed il crotonese. Musacchia sembrerebbe tipicamente siciliano, del palermitano, con presenze significative anche nel trapanese e nell'agrigentino. Musciacchia sembrerebbe unico. Musciacchio ha un ceppo lucano ed a Potenza ed uno pugliese, soprattutto nel tarentino.
Il cognome Musacchio è 147° nella regione Molise Il cognome Musacchio è 94° nella provincia di Campobasso Il cognome Musacchio è 2° nel comune di PORTOCANNONE (CB)