Dovrebbe derivare da soprannomi legati al vocabolo mosca, originati da caratteristiche caratteriali del capostipite (persona fastidiosa o molesta) oppure da nomi di località come Monte Moschitta nel catanese.
Il cognome Moschitta, rarissimo, è tipico della Sicilia, del catanese e dell'agrigentino. Moschitto, anch'esso rarissimo, dovrebbe essere originario di Augusta nel siracusano.
Il cognome Moschitto è 6880° nella regione Sicilia Il cognome Moschitto è 1080° nella provincia di Siracusa Il cognome Moschitto è 90° nel comune di PALUZZA (UD)