Potrebbe derivare da un soprannome legato al nome dell'insetto, la mosca, utilizzato pertanto per indicare una persona fastidiosa o molesta, oppure dall'attività del capostipite di produttore del vino moscato (da muscum, "muschio").
Nel caso del ceppo siciliano, è probabile che derivi dalla città araba di Mascate (Masqat, attuale capitale dell'Oman), dovuto alla presenza araba sull'isola tra il IX e il X secolo.
Il cognome Moscato è molto diffuso nella Sicilia occidentale ma ha un ceppo anche sulla fascia che comprende Lazio e Campania.
Il cognome Moscato è 569° nella regione Sicilia Il cognome Moscato è 59° nella provincia di Agrigento Il cognome Moscato è 4° nel comune di VAZZANO (VV)